Новостворений театр збанкрутував в 1645 році. Жана-Батіста ув'язнили за борги театру. Але, в тюрмі він пробув недовго, історики сперечаються про те, хто ж заплатив за нього - батько або коханець однієї з учасниць трупи. Саме на цей час припадає поява сценічного псевдоніма Мольєр. Можливо, цей псевдонім був придуманий для того, щоб не ганьбити батька наявністю актора в сім'ї (ця професія була упосліджене в суспільстві того часу).
Після звільнення з в'язниці Мольєр і Маделин стали давати театральні вистави в провінції, подорожуючи з міста в місто, із села в село. Така життя тривало 12 років, закінчившись успіхом і досягненням покровительства Філіпа Орлеанського над трупою.
Поступово слава Мольєра розросталася, у нього з'являлося все більше прихильників і все більше ворогів. Не дивлячись на захоплення трагедією, Мольєр став відомим завдяки своїм фарсах, який зазвичай складалися з одного акта і давалися після трагедії.
Подальша творча життя Мольєра безперервно пов'язана з нападками на нього представників церковної, медичної сфери, а також вищого суспільства і королівської захистом від подібних інцидентів. Багато п'єс були заборонені, багато довелося переробити, щоб мати можливість поставити.
У 1672 році помирає Маделин Бежа, страждання Мольєра пов'язані з цією втратою і з погіршується здоров'я відбилися на його творчості, він став менше писати, хоча на цей період припадають такі шедеври, як "Витівки Скапена", "Учення жінки", "Уявний хворий" .
З останньої п'єсою пов'язана смерть Мольєра. Він страждав на туберкульоз легень, який, можливо, був викликаний перебуванням у в'язниці в молодості. Під час виконання п'єси, в якій грав сам Мольєр, з ним трапився напад кашлю і кровотечі. Король наполягав на припинення виступу і відпочинку, але Мольєр відмовився і вирішив продовжувати гру, після чого з ним знову стався напад і він помер через кілька годин у себе вдома.
Так як акторів заборонялося ховати на кладовищах, таке ж заборона послідувало і щодо Мольєра. Завдяки королю, Мольєр все ж був похований, але вночі і в тій частині цвинтаря, яка призначалася для нехрещених дітей. У 1792 році його останки були перенесені в музей французьких пам'ятників, а в 1817 перепоховані на кладовищі Пер-Лашез, в Парижі.
Ревнощі Барбулье, фарс (1653)
Літаючий лікар, фарс (1653)
Очманілий, або Все невпопад, комедія у віршах (1655)
Любовна досада, комедія (1 656)
Смішні жеманніци, комедія (1659)
Сганарель, або Уявний рогоносець, комедія (1660)
Дон Гарсіа Наваррский, або Ревнивий принц, комедія (тисячу шістсот шістьдесят-один)
Школа мужів, комедія (1661)
Надокучливі, комедія (1 661)
Школа дружин, комедія (тисяча шістсот шістьдесят-два)
Критика «Школи дружин», комедія (+1663)
Версальський експромт (+1663)
Шлюб мимоволі, фарс (1664)
Принцеса Еліди, галантна комедія (одна тисяча шістсот шістьдесят чотири)
Тартюф, комедія (1664)
Дон Жуан, або Кам'яний бенкет, комедія (1665)
Любов-цілителька, комедія (1665)
Мізантроп, комедія (одна тисяча шістсот шістьдесят шість)
Лікар мимоволі, комедія (1666)
Мелісерта, пасторальна комедія (одна тисяча шістсот шістьдесят-шість, не закінчена)
Комічна пастораль (тисяча шістсот шістьдесят сім)
Сицилиец, або Любов-живописець, комедія (одна тисяча шістсот шістьдесят сім)
Амфітріон, комедія (1668)
Жорж Данден, або Обдурений чоловік, комедія (1668)
Скупий, комедія (1668)
Пан де Пурсоньяк, комедія-балет (1669)
Блискучі коханці, комедія (1670)
Міщанин у дворянстві, комедія-балет (1670)
Психея, трагедія-балет (1671, у співпраці з Філіпом Кіно і П'єром Корнелем)
Витівки Скапена, комедія-фарс (1 671)
Графиня д'Ескарбаньяс, комедія (1671)
Вчені жінки, комедія (+1672)
Уявний хворий, комедія з музикою і танцями (1673)