Після перемоги Ющенка всі політичні сили, які його підтримали, отримали свої квоти в новому уряді. Пост глави МВС після довгих торгів відійшов до СПУ, і його отримав Юрій Луценко - не мав ні юридичної освіти, ні досвіду правоохоронної роботи. Уже тоді, втім, говорили, що цьому призначенню сприяв не тільки Мороз, але і «укр. любі друзi президента »[8].
Як згадував Луценко, прийшовши в перший день на роботу в супроводі генерала міліції Геннадія Москаля (якого Луценко делегували в якості фахівця), він застав в будівлі міністерства порожні коридори. Ніхто його не зустрічав, всі співробітники поховалися хто куди. Сам колишній міністр Микола Білоконь спішно втік за кордон, кинувши своїх генералів напризволяще [8].
Запропонував ввести публічні «запрошення» свідків і підозрюваних на «бесіду», які прижилися в слідчій практиці. Правда, після заяв по телебаченню про «запрошенні» на допит в прокуратуру генерал МВС Олексій Пукач встиг сховатися від слідства [13]. а колишній керівник МВС Юрій Кравченко [14] і міністр транспорту і зв'язку України Георгій Кірпа застрелилися (за офіційною версією слідства) [15]. Пізніше Луценко визнав, що практику публічних запрошень слід припинити, хоча вона і давала потрібний результат [16].
Луценко також обіцяв довести до кінця розслідування обставин отруєння Віктора Ющенка. «Уже відомо, хто провозив через кордон отруту, який депутат її супроводжував, який чиновник приносив її до місця скоєння злочину і хто підмішували її в їжу» [17]. І ця обіцянка залишилася невиконаною. Пояснюючи це, Луценко посилався на неефективність і прямий саботаж розслідування «резонансних» кримінальних справ з боку Генеральної прокуратури України, яка, згідно із законодавством, здійснює слідство у справах про більшість тяжких злочинів, в той час як на органи МВС покладено тільки функція проведення дізнання (первинного збору доказів) [18].
Протест українців Австралії. Напис на плакаті: «Свободу Луценку».
Пізніше Апеляційний суд Києва продовжив термін арешту до 5 місяців. Після цього рішення Луценко оголосив голодування.
23 травня по закінченню досудового слідства і ознайомлення з матеріалами справи стартував судовий процес над Юрієм Луценком [40]. розгляд справи розпочався 27 травня в Печерському районному суді міста Києва. [41]
В ході судового розгляду Юрій Луценко і його адвокати неодноразово подавали клопотання про відвід суддів, зміну запобіжного заходу, вимозі суду присяжних, і виклику на судове засідання в якості свідків цілого ряду високопоставлених чиновників. [42]
Політична діяльність після звільнення
Є брат - Сергій Луценко [91]